Organizacijo in način poslovanja družbe, njene organe, pristojnosti, način odločanja organov ter druge zadeve, pomembne za poslovanje družbe ureja Statut Primorskega tehnološkega parka.

Primorski tehnološki park ima skupščino kot organ upravljanja. Poslovodno funkcijo v družbi opravlja direktor.

Za obravnavanje programskih in drugih strokovnih zadev s področja dejavnosti družbe in za pripravo strokovnih podlag za odločanje družbenikov je zadolžen Programski svet. Naloge Programskega sveta določa Poslovnik.

Družba ima tudi Svet podjetnikov kot posvetovalni organ.